В 2018 году Ивана Артюхова отстранили от должности, когда на него завели уголовное дело о растрате.

По версии следствия, совместно с проректором Борисом Краснопеевым, руководитель вуза заключил договор на ремонт главного корпуса, при этом фактически работы уже были выполнены. Университетских начальников подозревали в выводе из бюджета 1 миллиона 200 тысяч рублей. Однако спустя два года дело закрыли в связи с отсутствием состава преступления.
«7 каналу» Артюхов рассказал, что намерен обратиться в суд. Он не исключает, что вернётся в кресло ректора. Также он будет добиваться выплаты компенсации за моральный и материальный ущерб/